Qu'est-ce que le microbiome buccal ? Un guide simplifié pour comprendre l'écosystème de votre bouche

Pour comprendre cet écosystème et son importance pour les soins dentaires, il faut d’abord saisir les concepts de « biomes » et de « microbiomes ».

Les biomes sont des communautés de faune et de flore qui se forment en fonction des conditions de leur environnement naturel. Ces conditions environnementales déterminent le type de biome qui se développe : par exemple, un climat sec et aride favorise la faune et la flore d’un biome désertique. À mesure que les conditions changent, la flore et la faune présentes peuvent elles aussi évoluer.

Qu’est-ce donc qu’un microbiome ? Tout comme leurs homologues à plus grande échelle, les microbiomes sont des communautés d’organismes qui prospèrent au sein d'un environnement donné, mais à l’échelle microscopique.

Et plutôt que d’être situés dans une vaste région géographique, on les trouve dans des espaces plus restreints – comme sur notre corps et même à l’intérieur de notre bouche.

Qu’est-ce que le microbiome buccal ?

Le microbiome buccal est la communauté de bactéries, de champignons, de virus et d’autres micro-organismes qui vivent naturellement dans votre bouche. Lorsqu’il est équilibré, cet écosystème favorise la santé des dents, des gencives et la santé générale.

Même s’il peut être rebutant de penser qu’un grand nombre d’organismes microscopiques résident dans notre bouche, ces microbes y sont présents, que nous y pensions ou non. Ainsi, dans l’intérêt de notre santé personnelle, il est utile d’avoir au moins une connaissance sommaire de ce à quoi ressemble un microbiome buccal sain.

Comment fonctionne le microbiome buccal ?

Combien de micro-organismes vivent dans la bouche ?

La bouche humaine abrite environ 700 variétés de micro-organismes (1). Au total, la population d’un microbiome buccal moyen est d’environ 50 à 100 milliards de microbes. Non, ce n’est pas une faute de frappe ! Nous portons chacun dans notre bouche plus de microbes qu'il n'y a d'humains sur la Terre.

Quels types de microbes composent le microbiome buccal ?

Ces microbes comprennent des bactéries, des virus et des champignons. Il est important de retenir que, dans l’ensemble, le microbiome buccal se trouve dans un état d’eubiose, les micro-organismes entretenant un équilibre sain et des interactions bénéfiques entre eux.

Où vivent les microbes buccaux ?

Tout comme les violettes qui poussent sur le sol ombragé des forêts et les pics-verts qui nichent dans les branches creuses, les organismes du microbiome buccal ont eux aussi des endroits qu’ils considèrent comme leur habitat. Par exemple, certains prospèrent sur des surfaces dures comme les dents, tandis que d’autres préfèrent les tissus mous comme la langue et la muqueuse buccale.

Parmi la vaste population de micro-organismes résidant dans le microbiome buccal, on compte plusieurs microbes bénéfiques qui œuvrent jour après jour pour aider à maintenir l’équilibre de notre organisme.

Certaines bonnes bactéries peuvent être ajoutées pour favoriser un équilibre bénéfique. En effet, les probiotiques sont des micro-organismes vivants qui, lorsqu’ils sont administrés en quantités adéquates, confèrent un bénéfice pour la santé de l’hôte, selon la définition commune de la FAO et de l’OMS (2).

Bactéries bénéfiques et probiotiques

Les probiotiques ont été identifiés comme ayant un impact globalement bénéfique sur le bien-être de l’hôte. Les compléments probiotiques sont censés modifier positivement le microbiome en y apportant davantage de bactéries bénéfiques, soit pour le renforcer, soit pour le restaurer. Lorsque ces probiotiques atteignent notre intestin, ils facilitent la digestion. Au sein du microbiome buccal, ils combattent les microbes nuisibles qui menacent notre santé bucco-dentaire – et celle de l’organisme tout entier.

Les bactéries nocives du microbiome buccal

L'impact des microbes nocifs qui se développent et se multiplient est d'autant plus perceptible qu'ils perturbent notre bien-être. Découvrons ensemble ce que sont ces microbes et les effets néfastes qu'ils provoquent.

Bactéries nocives courantes présentes dans la bouche

Ces espèces comptent parmi les microbes les plus courants (3) que l’on trouve dans le microbiome buccal : 

• Streptococcus mutans : ces bactéries comptent parmi les principaux responsables de la carie dentaire. Elles métabolisent les sucres issus des aliments que nous consommons et produisent des acides comme sous-produits, ce qui entraîne la déminéralisation de l’émail dentaire et la formation de caries.
• Porphyromonas gingivalis : cette bactérie est associée à la parodontite, une forme sévère de maladie des gencives. P. gingivalis peut se développer dans les espaces entre les gencives et les dents, provoquant une inflammation, une récession gingivale et une perte dentaire potentielle si elle n’est pas traitée.
• Tannerella forsythia : Autre bactérie liée aux maladies parodontales, T. forsythia contribue à la formation de la plaque dentaire et déclenche une réponse immunitaire pouvant endommager les tissus gingivaux.
• Aggregatibacter actinomycetemcomitans : Quel nom à rallonge ! Cette bactérie est souvent associée à la parodontite agressive, qui peut évoluer rapidement et entraîner des lésions importantes au niveau des gencives et des structures de soutien des dents.
• Prevotella intermedia : P. intermedia est une autre bactérie couramment présente dans la plaque dentaire et impliquée dans les maladies parodontales.
• Candida albicans : Bien qu’il soit généralement présent en faible quantité, une prolifération excessive de ce champignon peut entraîner une candidose buccale, une affection caractérisée par des plaques blanches sur la langue, l’intérieur des joues et d’autres zones de la bouche.
• Fusobacterium nucleatum : cette bactérie joue un rôle dans la formation de biofilms à la surface des dents et est impliquée dans le développement des maladies parodontales.
• Treponema denticola : cette bactérie est souvent associée aux poches parodontales et est considérée comme l’un des principaux agents pathogènes de la maladie parodontale.

L’équilibre du microbiome buccal

Il est essentiel de noter que le microbiome buccal existe dans un équilibre dynamique, et que la présence de ces organismes nuisibles ne garantit pas nécessairement l’apparition de problèmes de santé bucco-dentaire. Dans un microbiome buccal sain, les bactéries, virus et champignons bénéfiques maintiennent un équilibre avec les organismes nuisibles, les empêchant ainsi de causer des problèmes importants.

Problèmes de santé liés à un déséquilibre du microbiome buccal

Parmi les effets néfastes sur la santé causés par une dysbiose ou un déséquilibre de notre microbiome buccal, on peut citer :

Mauvaise haleine (halitose)

Les microbes présents dans notre bouche produisent des gaz nauséabonds en se nourrissant des résidus alimentaires. Ces gaz peuvent entraîner une mauvaise haleine persistante, source de gêne sociale et d’une perte de confiance lors des interactions sociales

Accumulation de plaque dentaire et de tartre

La plaque dentaire est un film collant qui se forme sur nos dents en raison de l’accumulation de microbes nocifs, de particules alimentaires et de salive. Au fil du temps, si elle n’est pas correctement éliminée par un brossage régulier et le nettoyage des espaces interdentaires, la plaque dentaire peut durcir et se transformer en tartre, ce qui contribue à une coloration des dents et augmente le risque de caries et de maladies des gencives.

Caries dentaires

Les microbes nuisibles présents dans notre bouche se nourrissent des sucres contenus dans les aliments que nous consommons. En utilisant ces sucres, ils produisent des acides qui attaquent l’émail, la couche externe protectrice de nos dents. Cette érosion acide affaiblit l’émail, entraînant la formation de caries. Si elles ne sont pas traitées, les caries peuvent s’étendre et atteindre les couches internes de la dent, provoquant des douleurs, une sensibilité dentaire et nécessitant des traitements dentaires importants.

Maladies des gencives (gingivite et parodontite)

La plaque dentaire, si elle n’est pas éliminée efficacement, peut irriter et enflammer les gencives, entraînant une affection appelée gingivite, qui est un stade précoce de maladie des gencives. Si elle n’est pas traitée, la gingivite peut évoluer vers une parodontite. Les microbes nuisibles présents dans la plaque dentaire libèrent des toxines et provoquent une inflammation qui endommage davantage les gencives et les tissus de soutien autour des dents. En conséquence, les gencives peuvent se rétracter, créant des poches où encore plus de microbes nuisibles peuvent se développer. Avec le temps, cela peut entraîner la destruction de l'os et des ligaments qui maintiennent les dents en place, pouvant conduire à la perte des dents.

C’est lorsque les bactéries nocives peuvent se multiplier sans entrave que les problèmes de santé commencent à se manifester. Les problèmes de santé bucco-dentaire peuvent être un indicateur précoce de troubles de santé plus graves, tels que les maladies cardiovasculaires et le diabète. 

Au cœur de la matrice

Non, il ne s’agit pas d’une référence à la pop-culture, enfin, pas exactement. Tout comme la Matrice des films, la matrice du microbiome buccal protège les organismes qu’elle héberge, mais les similitudes s’arrêtent là.

 FAQ Biofilm buccal : vos questions sur la plaque dentaire

Comment le microbiome buccal influe sur la santé générale ?

Lorsque le microbiome buccal est déséquilibré, avec une prolifération de bactéries nocives et un déclin des microbes bénéfiques, cela peut entraîner diverses conséquences sur la santé au-delà de la bouche. Explorons les liens potentiels entre un microbiome buccal déséquilibré et son impact sur la santé générale.

L’inflammation chronique au-delà de la bouche

Un microbiome buccal déséquilibré peut déclencher une inflammation dans la bouche, entraînant des affections telles que la gingivite et la parodontite. Cependant, cette inflammation chronique peut également contribuer à une inflammation systémique, affectant d’autres parties du corps. Des niveaux élevés d’inflammation sont associés à divers problèmes de santé, notamment les maladies cardiovasculaires, le diabète et les maladies auto-immunes.

Le lien entre les maladies des gencives et les maladies cardiaques

Des recherches récentes suggèrent un lien possible entre la santé bucco-dentaire et la santé cardiovasculaire. Les bactéries responsables des maladies parodontales peuvent pénétrer dans la circulation sanguine par les gencives enflammées, ce qui peut entraîner une inflammation des vaisseaux sanguins et un risque accru d’athérosclérose (obstruction des artères) et de maladies cardiaques.

Le lien entre la santé bucco-dentaire, la santé cérébrale et le déclin cognitif

Certaines études indiquent que le microbiome buccal pourrait influencer la santé cérébrale. L’inflammation chronique provoquée par un déséquilibre du microbiome buccal pourrait déclencher une réponse inflammatoire systémique, affectant le cerveau et contribuant potentiellement à des maladies neurodégénératives telles que la maladie d’Alzheimer et la démence.

Pourquoi le diabète et la santé gingivale s’influencent mutuellement ?

Les maladies gingivales, souvent associées à un déséquilibre du microbiome buccal, ont été mises en relation avec la résistance à l'insuline et un diabète mal contrôlé. L’inflammation provoquée par les maladies des gencives peut aggraver la résistance à l’insuline et compliquer la gestion efficace de la glycémie chez les personnes diabétiques.

Le lien entre obésité et santé métabolique

Des recherches récentes suggèrent un lien possible entre les bactéries buccales et l’obésité. Un microbiome buccal déséquilibré pourrait influencer le microbiome intestinal et le métabolisme, contribuant potentiellement à la prise de poids et à l’obésité.

Ce que les études suggèrent concernant les bactéries buccales et le risque de cancer 

Bien que le lien direct entre un microbiome buccal déséquilibré et le cancer est encore en cours d’évaluation, certaines études ont mis en évidence des associations entre certaines bactéries buccales et un risque accru de certains cancers, notamment le cancer de la bouche et le cancer du pancréas.

Comment la santé bucco-dentaire influe sur les maladies auto-immunes ?

Un microbiome bucco-dentaire déséquilibré peut contribuer à la dérégulation du système immunitaire. Ce dérèglement peut augmenter le risque de maladies auto-immunes, dans lesquelles le système immunitaire attaque par erreur des cellules et des tissus sains.

Dans l’ensemble, l’équilibre du microbiome buccal est essentiel au maintien de la santé bucco-dentaire et peut influencer de manière significative divers aspects de la santé générale. Un microbiome buccal équilibré, composé d’une grande diversité de micro-organismes bénéfiques, renforce les défenses naturelles de l’organisme, facilite la digestion et contribue à empêcher les bactéries nocives de provoquer des problèmes systémiques. 

Maintenir un équilibre sain au sein du microbiome buccal

La clé pour favoriser un microbiome buccal équilibré réside dans une combinaison de mesures proactives, telles que de bonnes pratiques d’hygiène bucco-dentaire, limitant l’accumulation de bactéries, et de contrôler ce qui alimente le biofilm dans la matrice. Grâce à ces mesures, nous pouvons favoriser efficacement la croissance des bactéries bénéfiques et préserver notre santé bucco-dentaire ainsi que notre santé générale.

Explorons en détail ces pratiques essentielles afin de comprendre comment parvenir à un microbiome buccal équilibré et le maintenir en harmonie.

Eviter les aliments et boissons sucrés

Les sucres, en particulier les sucres raffinés et les glucides, constituent une source de nourriture privilégiée pour les bactéries nocives présentes dans le microbiome buccal. Lorsque nous consommons des aliments et des boissons sucrés, ces bactéries métabolisent les sucres et produisent des acides comme sous-produits. Ces acides peuvent éroder l’émail, la couche externe protectrice de nos dents, ce qui peut entraîner des caries et la détérioration des dents. De plus, l’excès de sucre dans la bouche peut créer un environnement favorable à la prolifération des bactéries nocives, perturbant ainsi l’équilibre naturel du microbiome buccal.

Limiter le tabagisme 

Fumer et consommer du tabac sont néfastes pour la santé bucco-dentaire et peuvent perturber l’équilibre du microbiome buccal. Les substances chimiques présentes dans les produits du tabac peuvent provoquer une irritation et une inflammation des gencives, ce qui augmente le risque de maladies parodontales. De plus, le tabagisme affaiblit le système immunitaire, ce qui rend plus difficile pour l’organisme de lutter contre les bactéries nocives présentes dans la bouche.

Consommez de l’alcool avec modération

Une consommation excessive d’alcool peut avoir plusieurs effets négatifs sur la santé bucco-dentaire. L'alcool est connu pour provoquer une sécheresse buccale, réduisant ainsi la production de salive. La salive joue un rôle essentiel dans le maintien d'un environnement buccal sain en éliminant les particules alimentaires et en neutralisant les acides. Une bouche sèche peut créer un environnement idéal pour la prolifération des bactéries nocives, entraînant un déséquilibre du microbiome buccal.

Adoptez un rituel complet d’hygiène bucco-dentaire

En intégrant une hygiène bucco-dentaire complète à votre rituel quotidien, deux fois par jour, pour éliminer la plaque dentaire, vous pouvez contribuer activement à l'équilibre de votre microbiome buccal.

Ce rituel consiste à :

1.  Nettoyer quotidiennement entre vos dents

Nettoyez vos espaces interdentaires à l’aide d’accessoires interdentaires tels que du fil dentaire, des bâtonnets interdentaires ou des brossettes interdentaires. Ce nettoyage interdentaire joue un rôle essentiel dans l’hygiène bucco-dentaire en ciblant les zones situées entre les dents et le long du sillon gingival, zones inaccessibles à la brosse à dents.

Ces espaces retiennent souvent des particules alimentaires et de la plaque dentaire qui, si elles ne sont pas éliminées, peuvent entraîner des caries et une inflammation des gencives. Le nettoyage interdentaire aide à déloger les débris et à empêcher la formation de plaque dentaire, ce qui contribue à un microbiome buccal plus sain et réduit le risque de maladies gingivales.

2. Se brosser soigneusement les dents deux fois par jour 

Se brosser les dents correctement et minutieusement avec la brosse à dents adaptée et un dentifrice. Un brossage régulier et avec la méthode appropriée est la base de bons soins bucco-dentaires. Le brossage élimine les résidus alimentaires, la plaque dentaire et les bactéries présents à la surface des dents et des gencives, empêchant ainsi l’accumulation de substances nocives pouvant entraîner des caries et des maladies gingivales.

3.  Réaliser un bain de bouche pour une action complémentaire

Les bains de bouche constituent un complément précieux aux routines d’hygiène bucco-dentaire, car ils offrent plusieurs avantages. Les bains de bouche peuvent aider à réduire la quantité de bactéries présentes dans la bouche, ce qui contribue à lutter contre la mauvaise haleine et à prévenir l’accumulation de plaque dentaire. Certains bains de bouche contiennent du fluor, offrant ainsi une protection supplémentaire contre les caries. Les bains de bouche antimicrobiens peuvent contribuer à réduire l’inflammation des gencives et à prévenir la gingivite. Il est important d’utiliser le bain de bouche de manière ciblée et de suivre les recommandations des professionnels.

Consultez régulièrement votre chirurgien-dentiste 

Les contrôles dentaires réguliers et les nettoyages professionnels constituent des éléments essentiels pour votre santé bucco-dentaire. Les dentistes jouent un rôle crucial en proposant des soins professionnels, leur expertise et des conseils personnalisés. Prenez rendez-vous au moins une fois par an.

Sources :

(1) Mouth Microbes, The Helpful and the Harmful, News in Health, Mai 2019

(2) 20th Anniversary of the FAO/WTO definition of probiotic microorganisms in food and food supplements, IAP Europe, Novembre 2025

(3) Chandra Nayak S, Latha PB, Kandanattu B, Pympallil U, Kumar A, Kumar Banga H. The Oral Microbiome and Systemic Health: Bridging the Gap Between Dentistry and Medicine. Cureus. 2025 Feb 12;17(2):e78918. doi: 10.7759/cureus.78918. PMID: 40091996; PMCID: PMC11909285.